数据挖掘—miRNA调节网络的构建

课程简介

由于人类的基因数量巨大,miRNA作为调控这些基因表达的非编码RNA,其与基因的关系非常复杂。当前基因样本数目高达两万多维,随着维数的增加,获取基因与miRNA之间的关系的难度也随之增加。近年来关于基因和miRNA之间关系的研究成为生物信息学的一个热点。研究者们发现众多疾病间存在很多共性,比如某些基因和miRNA在多种疾病中都有相似的表达,需要通过一定方法识别这些疾病中相关的miRNA和基因的调控关系。目前建立两者的调控关系方法有很多，包括数据库比对，算法的运用，实验的验证等等。这些都会通过详细的介绍传递给大家。并会通过具体的操作向大家演示如何构建两者的关系。相较于之前推出的《豪斯医生基因数据挖掘》和《WGCNA详解》，此次课程在内容上进行了延伸，将重点回到了非编码RNA的调控网络上。这过程中，不仅会重新温故之前的知识，又将WGCNA作为一种新的算法构建miRNA与mRNA的关系。

具体地，你将进一步了解非编码RNA数据的下载和处理，WGCNA的理论和操作，数据库的比对，cytoscape的灵活玩转，还有R语言的基本语法。该课程的学习会为大家在科研的道路中增加新的助力。

课程目录

01、TCGA概述

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• 02、TCGA概述.mp4
• 03、TCGA概述.mp4

02、构建调控关系理论

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• 02、构建调控关系理论.mp4
• 03、构建调控关系理论.mp4

03、WGCNA理论

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• 02、WGCNA理论.mp4
• 03、WGCNA理论.mp4
• 04、WGCNA理论.mp4

04、数据下载

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• 03、数据下载.mp4
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05、提取蛋白编码基因

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• 02、提取蛋白编码基因.mp4
• 03、提取蛋白编码基因.mp4
• 04、提取蛋白编码基因.mp4
• 05、提取蛋白编码基因.mp4

06、差异分析

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• 03、差异分析.mp4

07、基于算法构建调控

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• 02、基于算法构建调控.mp4
• 03、基于算法构建调控.mp4
• 04、基于算法构建调控.mp4

08、cytoscape构建网络

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• 02、cytoscape构建网络.mp4

09、数据库预测

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• 04、数据库预测.mp4